К изучению видовой и функциональной структуры микробиома винограда в ампелоценозах Республики Узбекистан
PDF

Ключевые слова

виноград; сорт; агенты биологического контроля; эндофиты; ризосфера; бактерии; грибы; идентификация; секвенирование 16S рРНК и 18S рРНК.

Аннотация

В статье представлены результаты биоценотических исследований микробиома винограда. Полевые исследования проводились на промышленных виноградниках «Алижон Кувончбек Боги» в Сырдарьинской области Республики Узбекистан, выделение микроорганизмов – на кафедре «Биотехнология» Ташкентского химико-технологического института. В ФГБУН «ВННИИВиВ «Магарач» РАН» проводились молекулярно-генетические исследования по прочтению последовательностей, а также идентификации бактерий и грибов методом ПЦР-анализа в лаборатории молекулярно-генетических исследований; лабораторные исследования антагонистической активности микроорганизмов, ассоциированных с виноградом в отношении патогенных микромицетов в лаборатории защиты растений. На основе секвенирования последовательности гена 16S рибосомной РНК бактерий при сравнении полученных последовательностей с базой данных NCBI выделенные 2 штамма бактерий были идентифицированы как Nacardiopsis dassonvillei (99,78 % совпадение) либо генетически близкий ему вид, и Streptomyces spp.: S. parvus, S. rubiginosohelvolus, S. albovinaceus (100 % совпадение). По результатам секвенирования последовательности гена, кодирующего 18S рибосомной РНК, выделенные 3 штамма грибов идентифицированы как Trichoderma virens (97,17 %), Fusarium fujikuroi (100 %) и Aspergillus spp. (наиболее генетически близкие виды A. puulaauensis, A. heteromorphus, A. lentulus и A. novofumigatus). Результаты изучения антагонистической активности выделенных бактерий и грибов в условиях in vitro показали перспективность их использования в качестве агентов биологического контроля развития болезней виноградных растений.

PDF