Магарач
Оценка уровня аллельного полиморфизма SSR-маркеров и генетических дистанций некоторых сортов винограда Юга России разных эколого-географических групп
PDF

Ключевые слова

виноград; Vitis vinifera; микросателлитные локусы; эколого-географические группы

Аннотация

Представлены результаты оценки генетического разнообразия 24 местных сортов юга России, поддерживаемых на ампелографической коллекции ФГБУН «ВННИИВиВ «Магарач». ДНК-типирование сортов и оценка аллельного разнообразия выполнено с использованием 9 ядерных (nSSR) и 3 хлоропластных (cpSSR) микросателлитных локусов.
Уровень полиморфизма nSSR локусов составил 100 %. Всего было идентифицировано 73 аллеля, в среднем 9.1 аллеля / локус. Минимальное количество аллелей идентифицировано в локусах ssrVrZAG64 и ssrZag83. Наибольшее количество аллелей выявлено в локусе ssrVvUCH29 (13 аллелей), диапазон размера которых составил 203 п.н. – 309 п.н. В результате анализа полиморфизма сpSSR-локусов идентифицировано 4 хлоротипа: А, В, С, D. Наиболее распростанен в группе изученных сортов хлоротип D (58 %). В статье обсуждается происхождение сортов на основе анализа их гаплотипов. По
результатами анализа аллельного полиморфизма nSSR-локусов рассчитана матрица генетических дистанций, значения которой находились в диапазоне 0,33–0,94, построена дендрограмма, отражающая взаимоотношения между образцами. По степени генетического сходства выделились 3 основных кластера, в которых наблюдалась дифференциация или тенденция к дифференциации по эколого-географическим группам.

PDF