Архив / 2023 / Том 25, № 1 (2023) - “Магарач”. Виноградарство и виноделие
К изучению видовой и функциональной структуры микробиома винограда в ампелоценозах Республики Узбекистан
Том 25, № 1 (2023)
Турабекова Дилором Бахтияровна ORCID, Алейникова Наталья Васильевна ORCID, Спотарь Геннадий Юрьевич ORCID, Галкина Евгения Спиридоновна ORCID, Болотянская Елена Александровна ORCID, Хужамшукуров Нортожи Абдихаликович ORCID
- Турабекова Дилором Бахтияровна - Ташкентский химико-технологический институт
- Алейникова Наталья Васильевна - Всероссийский национальный научно-исследовательский институт виноградарства и виноделия «Магарач» РАН
- Спотарь Геннадий Юрьевич - Всероссийский национальный научно-исследовательский институт виноградарства и виноделия «Магарач» РАН
- Галкина Евгения Спиридоновна - Всероссийский национальный научно-исследовательский институт виноградарства и виноделия «Магарач» РАН
- Болотянская Елена Александровна - Всероссийский национальный научно-исследовательский институт виноградарства и виноделия «Магарач» РАН
- Хужамшукуров Нортожи Абдихаликович - Научно-исследовательский институт генетических ресурсов растений Минсельхоз РУз
To the study of species and functional composition of grape microbiome in ampelocenoses of the Republic of Uzbekistan
Аннотация
В статье представлены результаты биоценотических исследований микробиома винограда. Полевые исследования проводились на промышленных виноградниках «Алижон Кувончбек Боги» в Сырдарьинской области Республики Узбекистан, выделение микроорганизмов – на кафедре «Биотехнология» Ташкентского химико-технологического института. В ФГБУН «ВННИИВиВ «Магарач» РАН» проводились молекулярно-генетические исследования по прочтению последовательностей, а также идентификации бактерий и грибов методом ПЦР-анализа в лаборатории молекулярно-генетических исследований; лабораторные исследования антагонистической активности микроорганизмов, ассоциированных с виноградом в отношении патогенных микромицетов в лаборатории защиты растений. На основе секвенирования последовательности гена 16S рибосомной РНК бактерий при сравнении полученных последовательностей с базой данных NCBI выделенные 2 штамма бактерий были идентифицированы как Nacardiopsis dassonvillei (99,78 % совпадение) либо генетически близкий ему вид, и Streptomyces spp.: S. parvus, S. rubiginosohelvolus, S. albovinaceus (100 % совпадение). По результатам секвенирования последовательности гена, кодирующего 18S рибосомной РНК, выделенные 3 штамма грибов идентифицированы как Trichoderma virens (97,17 %), Fusarium fujikuroi (100 %) и Aspergillus spp. (наиболее генетически близкие виды A. puulaauensis, A. heteromorphus, A. lentulus и A. novofumigatus). Результаты изучения антагонистической активности выделенных бактерий и грибов в условиях in vitro показали перспективность их использования в качестве агентов биологического контроля развития болезней виноградных растений.
Abstract
The article presents the results of biocenotic studies of grape microbiome. Field studies were carried out in the industrial vineyards “Alijon Kuvonchbek Bogi” in the Syrdarya region of the Republic of Uzbekistan, the isolation of microorganisms - in the Department of Biotechnology of the Tashkent Institute of Chemical Technology. Molecular genetic studies were carried out in the FSBSI Institute Magarach of the RAS to read the sequences, as well as to identify bacteria and fungi using PCR analysis in the Laboratory of Molecular Genetic Research; laboratory studies of microorganism antagonistic activity associated with grapes against pathogenic micromycetes - in the Laboratory of Plant Protection. Based on the sequencing of 16S ribosomal RNA gene of bacteria, when comparing the obtained sequences with the NCBI database, the isolated 2 bacterial strains were identified as Nacardiopsis dassonvillei (99.78 % match) or a genetically close species, and Streptomyces spp.: S. parvus, S. rubiginosohelvolus, S. albovinaceus (100 % match). According to the sequencing results of gene sequence encoding 18S ribosomal RNA, 3 strains of fungi were identified as Trichoderma virens (97.17 %), Fusarium fujikuroi (100 %) and Aspergillus spp. (the most genetically related species are A. puulaauensis, A. heteromorphus, A. lentulus, and A. novofumigatus). The research results of antagonistic activity of the isolated bacteria and fungi in vitro showed the promising outlook of their use as biological control agents against the development of grape plant diseases.
Как цитировать
Турабекова Дилором Бахтияровна; Алейникова Наталья Васильевна; Спотарь Геннадий Юрьевич; Галкина Евгения Спиридоновна; Болотянская Елена Александровна; Хужамшукуров Нортожи Абдихаликович К изучению видовой и функциональной структуры микробиома винограда в ампелоценозах Республики Узбекистан // Магарач. Виноградарство и виноделие. 2023. Т. 25. № 1. С. 43-50. DOI: 10.34919/IM.2023.25.1.006.