Исследование аллельного разнообразия VvMybA1 клоновых популяций распространенных винных сортов: doi 10.35547/iM.2019.21.4.003

Аннотация

Изучение агробиологических свойств сортов в привязке к их генетике имеет важное значение как
для прикладных, так и для фундаментальных исследований. одним из наиболее ярко выраженных
признаков у виноградного растения является наличие или отсутствие антоциановой окраски ягод,
которая, в свою очередь, контролируется кластером генов MYB, расположенных во второй хромосоме
кариотипа. особенный интерес для научного сообщества представляют клоны сортов, являющихся референсными при сравнении для изучения генетического разнообразия рода Vitaceae. таким образом, в статье представлены результаты изучения строения аллелей гена VvMyba1 у 32 клонов
известных распространенных сортов винограда: Мерло, каберне-совиньон, Рислинг, алиготе, Пино
белый и совиньон блан. В результате, у всех клонов были выявлены аллели гена VvMyba1, характерные
для окрашенных и неокрашенных сортов. Это же подтверждается результатом сравнения секвенированных последовательностей с базой данных ncBi, при помощи сервиса ncBi BlaSt. для всех клонов неокрашенных сортов было установлено наличие аллели с ретротранспозонной вставкой, блокирующей нормальную экспрессию гена и, следовательно, детерминирующего отсутствие антоцианинов в ягодах. также были обнаружены одно- и динуклеотидные замены, являющиеся общими для групп и некоторых отдельных клонов и в целом характерные для белоягодных и красноягодных сортов. Помимо этого, были выявлены мутационные различия, характерные для конкретных клонов, которые, в свою очередь, выражены в двоении нуклеотидных пиков при секвенировании и объясняются гетерогенностью изученных генотипов, то есть их происхождением. таким образом, при изучении клонов шести сортов было подтверждено наличие в них характерных аллелей, выявлены уникальные для окрашенных и неокрашенных сортов изменения, а также созданы референсные последовательности генов сортов, содержащихся на ампелографическом участке анапской зональной опытной станции, которые могут использоваться в дальнейшей работе по изучению данного признака.