Архив / 2019 / Том 21, № 4 (2019) - “Магарач”. Виноградарство и виноделие
Исследование аллельного разнообразия VvMybA1 клоновых популяций распространенных винных сортов
Том 21, № 4 (2019)
Милованов Александр Валериевич ORCID, Ильницкая Елена Тарасовна, Звягин Андрей Сергеевич, Радченко Виталий Владиславович, Кощаев Андрей Георгиевич, Трошин Леонид Петрович
- Милованов Александр Валериевич - ФГБОУ ВО «кубанский государственный аграрный университет имени и.т. трубилина»
- Ильницкая Елена Тарасовна - Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Северо-Кавказский федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»
A study of VvMybA1 allele diversity in populations of clones of popular wine grape varieties
Аннотация
Изучение агробиологических свойств сортов в привязке к их генетике имеет важное значение как
для прикладных, так и для фундаментальных исследований. одним из наиболее ярко выраженных
признаков у виноградного растения является наличие или отсутствие антоциановой окраски ягод,
которая, в свою очередь, контролируется кластером генов MYB, расположенных во второй хромосоме
кариотипа. особенный интерес для научного сообщества представляют клоны сортов, являющихся референсными при сравнении для изучения генетического разнообразия рода Vitaceae. таким образом, в статье представлены результаты изучения строения аллелей гена VvMyba1 у 32 клонов
известных распространенных сортов винограда: Мерло, каберне-совиньон, Рислинг, алиготе, Пино
белый и совиньон блан. В результате, у всех клонов были выявлены аллели гена VvMyba1, характерные
для окрашенных и неокрашенных сортов. Это же подтверждается результатом сравнения секвенированных последовательностей с базой данных ncBi, при помощи сервиса ncBi BlaSt. для всех клонов неокрашенных сортов было установлено наличие аллели с ретротранспозонной вставкой, блокирующей нормальную экспрессию гена и, следовательно, детерминирующего отсутствие антоцианинов в ягодах. также были обнаружены одно- и динуклеотидные замены, являющиеся общими для групп и некоторых отдельных клонов и в целом характерные для белоягодных и красноягодных сортов. Помимо этого, были выявлены мутационные различия, характерные для конкретных клонов, которые, в свою очередь, выражены в двоении нуклеотидных пиков при секвенировании и объясняются гетерогенностью изученных генотипов, то есть их происхождением. таким образом, при изучении клонов шести сортов было подтверждено наличие в них характерных аллелей, выявлены уникальные для окрашенных и неокрашенных сортов изменения, а также созданы референсные последовательности генов сортов, содержащихся на ампелографическом участке анапской зональной опытной станции, которые могут использоваться в дальнейшей работе по изучению данного признака.
Abstract
research into agrobiological characteristics of grape varieties in connection
with their genetics is important both for applied and fundametal studies.
the presence or absence of anthocyanin color of the berries is one of the
best expressed traits of grape plant. this trait is controled by the cluster of
MYB genes located in the second chromosome of the caryotype. Some grape
varieties serve as references in comparative studies aimed to investigate
the Vitaceae genetic diversity, and clones of such varieties are of special
interest. the paper reports findings regarding the structure of alleles of
VvMyba1 gene in 32 clones of popular grape varieties: ‘Merlot’, ‘aligoté’,
‘cabernet Sauvignon’, ‘Pinot blanc’, ‘riesling’ and ‘Sauvignon blanc’. alleles
of VvMyba1 gene that are typical of varieties with colored or noncolored
berries were detected in all study clones, and this was confirmed by comparing the sequenated sequences to the ncBi database with the aid of the ncBi
BlaSt service. it was established that all study clones of varieties with
noncolored berries had an allele with a retrotransposon insertion blocking
normal expression of the gene which, therefore, determines the absence of
anthocyanins in the berries. one- and di-nucleotide replacements common
to groups of the study clones and to some individual study clones were
also detected. these replacements are, on the whole, typical of white-and
red-berried grape vartieties. in addition, mutation-related differences typical
of definite clones were revealed. these differences manifest themselves by
double nucleotide peaks in sequencing and can be ascribed to heterogeneity of the study genotypes, i. e. their origin. thus, the presence of typical
alleles in the study clones of six grape varieties was confirmed, changes
unique to varieties with colored and noncolored berries were revealed,
and reference sequences of genes maintained in the collection plot of the
anapa Zonal Experiment Station were developed, for further research into
the trait of interest.
Как цитировать
Милованов Александр Валериевич; Ильницкая Елена Тарасовна; Звягин Андрей Сергеевич; Радченко Виталий Владиславович; Кощаев Андрей Георгиевич; Трошин Леонид Петрович Исследование аллельного разнообразия VvMybA1 клоновых популяций распространенных винных сортов // Магарач. Виноградарство и виноделие. 2019. Т. 21. № 4. С. 294-298. DOI: 10.35547/iM.2019.21.4.003.