Архив / 2019 / Том 21, № 4 (2019) - “Магарач”. Виноградарство и виноделие
Генотипирование сортов винограда селекции Института «Магарач» на основе анализа аллельного полиморфизма SSR локусов
Том 21, № 4 (2019)
Гориславец Светлана ORCID, Володин Виталий Александрович ORCID, Спотарь Геннадий Юрьевич ORCID, Рисованная Валентина Ивановна ORCID, Алексеев Яков Игоревич
- Гориславец Светлана - Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Всероссийский национальный научно-исследовательский институт виноградарства и виноделия «Магарач» РАН»
- Володин Виталий Александрович - Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Всероссийский национальный научно-исследовательский институт виноградарства и виноделия «Магарач» Ран»
- Спотарь Геннадий Юрьевич - Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Всероссийский национальный научно-исследовательский институт виноградарства и виноделия «Магарач» Ран»
- Рисованная Валентина Ивановна - Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Всероссийский национальный научно-исследовательский институт виноградарства и виноделия «Магарач» Ран»
- Алексеев Яков Игоревич - Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Всероссийский национальный научно-исследовательский институт виноградарства и виноделия «Магарач» Ран»
Genotyping of grape varieties released by the Institute Magarach based on analysis of allelic polymorphism of SSR loci
Аннотация
обязательными условиями успешного сохранения и
использования различных сортов сельскохозяйственных культур является идентификация и контроль
генетической изменчивости сортов, для изучения
которой используются различные методы, в том
числе методы молекулярно-генетического анализа.
В связи с быстрым развитием селекции, ежегодно
появляются десятки новых сортов винограда, требующих паспортизации. Молекулярные маркеры
могут способствовать подбору родительских пар для
скрещивания, повышению точности и ускорению
селекционного процесса, так как идентификация исходного материала с использованием молекулярных
маркеров и анализ результатов скрещивания могут
быть выполнены в достаточно короткий период. к
наиболее информативным молекулярным маркерам
относятся микросателлитные маркеры, основанные
на анализе простых повторяющихся повторов (simple
sequence repeats, SSr). анализ полиморфизма SSr локусов позволяет изучить генетическую изменчивость
сельскохозяйственных культур на уровне генома.
цель нашего исследования – генотипирование, оценка
аллельного разнообразия и днк-паспортизация ряда
сортов винограда селекции института «Магарач» на
основе SSr анализа. основной метод, использованный
в работе, – полимеразная цепная реакция (ПцР) и
фрагментный анализ продуктов ПцР на генетическом
анализаторе aBi 3130. В результате фрагментного
анализа были генотипированы 8 селекционных сортов
института «Магарач» по 9 ядерным микросателлитным
локусам (nSSr). Размеры аллелей оценены с помощью
программы Gene Mapper v. 4.0. Полиморфизм микросателлитных локусов и генетическое разнообразие
рассчитано с использованием программы Popgene
(v. 1.32). сравнительный анализ nSSr профилей днк
изученных сортов позволил установить, что все сорта
имеют уникальные профили. Всего идентифицировано 69 аллелей, среднее число аллелей – 7,67 аллелей/
локус. на основании размеров аллелей составлены
индивидуальные молекулярно-генетические паспорта
в соответствии с международными стандартами.
Abstract
identification and control of genetic variation of different varieties of
agricultural crops enter as prerequisites for their efficient conservation
and use. Genetic variation is investigated by means of a wide set of
methods, including those relying on molecular-genetic analysis. Every
year, dozens of new breedings of grapevine come into being, and their
passportization is necessary. Molecular markets can promote selection
of parent pairs for crossing, improve efficiency of breeding and accelerate the process as enable both identification of the initial material and
analysis of crossing results to be done in a sufficiently short period of time.
the highest information value is associated with microsatellite markers
consisting of simple sequence repeats (SSr). analysis of polymorphism
of SSr loci allows to investigate genetic variation of agricultural crops at
the level of genome. the goals of the study were to conduct genotyping
of a number of grape breedings developed by the institute Magarach, to
assess their allelic diversity and to achieve dna passportization based
on SSr analysis. Polymerase chain reaction (Pcr) and fragment analysis
of Pcr products with the use of a genetic analizer aBi 3130 were the
main methods the study relied upon. as a result of the aforesaid analysis,
eight new breedings of the institute were genotyped for nine nuclear
microsatellite loci (nSSr). the sizes of alleles were assessed using Gene
Mapper v. 4.0 software. Popgene (v. 1.32) software was used to calculate
polymorphism of microsatellite loci and genetic diversity. a comparative
nSSr-analysis of dna-profiles of the study varieties indicated that all of
them had unique profiles. a total of 69 alleles were identified, with 7.67
alleles per locus on an average. Based on the sizes of the alleles, individual
molecular-genetic passports of the varieties were made, in accordance
with international standards.
Как цитировать
Гориславец Светлана; Володин Виталий Александрович; Спотарь Геннадий Юрьевич; Рисованная Валентина Ивановна; Алексеев Яков Игоревич Генотипирование сортов винограда селекции Института «Магарач» на основе анализа аллельного полиморфизма SSR локусов // Магарач. Виноградарство и виноделие. 2019. Т. 21. № 4. С. 289-293. DOI: 10.35547/iM.2019.21.4.002.